A Tripal 扩展模块,提供了针对种质的特殊字段和导入器。
4.x-dev
2024-04-10 16:23 UTC
Requires
- php: ^8.1
- drupal/core: ^10.0
- tripal/tripal: ^4.0-alpha1
- tripalcultivate/base: *
This package is auto-updated.
Last update: 2024-09-10 17:23:11 UTC
README
由萨斯喀彻温大学脉类作物生物信息学团队开发。
注意:此包将替换以下 Tripal v3 模块:uofspb_germplasm。
- 种质导入器
- 将种质杂交和样本批量导入数据库
- 种质集合
- 支持将种质分组到集合中
- 一个用于列出种质集合的表的专用字段
- 一个用于在项目页面上列出种质集合的字段
- RIL 概述
- 提供了一个表格形式的种质矩阵,总结了用作父本的每种物种中可用的 RIL 数量
- 特定物种组合的 RIL 列表,包括 RIL 开发的当前进度
- RIL 种质页面上的字段,用于总结开发进度
引用
如果您在 Tripal 网站上使用此模块,请在描述您生成的 Tripal 网站的地方引用我们的工作。例如,如果您在期刊上发布您的网站,则此引用应包含在参考文献部分,并且在上文中任何讨论此模块提供功能的地方都应引用它。
Lacey-Anne Sanderson,Carolyn T Caron 和 Reynold Tan(2023)。TripalCultivate 种质:针对种质的专用 Tripal 字段和导入器。开发版本。萨斯喀彻温大学,脉类作物研究组,萨斯卡通,SK,加拿大。
安装
使用 composer,在 Drupal 网站的根目录下使用以下命令将此包添加到您的 Drupal 网站:
composer require tripalcultivate/germplasm
这将下载模块目录中最新的版本。您可以在Drupal 文档中查看更多信息。
然后您可以使用 Drush 或 Drupal 网站上的扩展页面来安装它。
drush en trpcultivate_germplasm
技术堆栈
请参阅以下自动测试部分中的特定版本兼容性。
- Drupal
- Tripal 4.x
- PostgreSQL
- PHP
- Apache2
自动测试
此包致力于高标准化的自动测试。我们使用 PHPUnit 进行测试,并使用 CodeClimate 确保良好的测试覆盖率和可维护性。有关我们具体的可维护性问题测试覆盖率的更多详细信息,请参阅我们的 CodeClimate 项目页面。
以下兼容性是通过自动测试工作流程证明的。