A Tripal 扩展模块,提供了针对种质的特殊字段和导入器。

4.x-dev 2024-04-10 16:23 UTC

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Last update: 2024-09-10 17:23:11 UTC


README

由萨斯喀彻温大学脉类作物生物信息学团队开发。

注意:此包将替换以下 Tripal v3 模块:uofspb_germplasm

  • 种质导入器
    • 将种质杂交和样本批量导入数据库
  • 种质集合
    • 支持将种质分组到集合中
    • 一个用于列出种质集合的表的专用字段
    • 一个用于在项目页面上列出种质集合的字段
  • RIL 概述
    • 提供了一个表格形式的种质矩阵,总结了用作父本的每种物种中可用的 RIL 数量
    • 特定物种组合的 RIL 列表,包括 RIL 开发的当前进度
    • RIL 种质页面上的字段,用于总结开发进度

引用

如果您在 Tripal 网站上使用此模块,请在描述您生成的 Tripal 网站的地方引用我们的工作。例如,如果您在期刊上发布您的网站,则此引用应包含在参考文献部分,并且在上文中任何讨论此模块提供功能的地方都应引用它。

Lacey-Anne Sanderson,Carolyn T Caron 和 Reynold Tan(2023)。TripalCultivate 种质:针对种质的专用 Tripal 字段和导入器。开发版本。萨斯喀彻温大学,脉类作物研究组,萨斯卡通,SK,加拿大。

安装

使用 composer,在 Drupal 网站的根目录下使用以下命令将此包添加到您的 Drupal 网站:

composer require tripalcultivate/germplasm

这将下载模块目录中最新的版本。您可以在Drupal 文档中查看更多信息。

然后您可以使用 Drush 或 Drupal 网站上的扩展页面来安装它。

drush en trpcultivate_germplasm

技术堆栈

请参阅以下自动测试部分中的特定版本兼容性。

  • Drupal
  • Tripal 4.x
  • PostgreSQL
  • PHP
  • Apache2

自动测试

此包致力于高标准化的自动测试。我们使用 PHPUnit 进行测试,并使用 CodeClimate 确保良好的测试覆盖率和可维护性。有关我们具体的可维护性问题测试覆盖率的更多详细信息,请参阅我们的 CodeClimate 项目页面

MaintainabilityBadge TestCoverageBadge

以下兼容性是通过自动测试工作流程证明的。