pgb-liv/php-ms

PHP质谱分析工具库

v1.0.0 2017-11-01 11:09 UTC

This package is auto-updated.

Last update: 2024-09-16 00:54:50 UTC


README

phpMs 是一个基于 PHP 的免费开源库,用于蛋白质组学。该库包含一组用于存储常用数据的核心类,例如光谱、肽和蛋白质。此外,该库还包含多种常见文件格式的读取器和/或写入器,包括 MGF、FASTA、mzIdentML、proBed。该库还包含用于蛋白质消化、肽裂解和搜索引擎集成的许多实用工具。

Build Status Quality Gate

Test Success Unit Test Coverage SQALE Debt Ratio

需求

  • PHP 版本 5.4+
    • ext/xsl

安装

要安装该库,请使用 Composer

composer require pgb-liv/php-ms

或者将其添加到现有的 composer.json 文件中

"require" : {
    "pgb-liv/php-ms" : "1.*"
},

GitHub 和 GitHub 源发布的内容不包括依赖代码。建议您始终通过 Composer 使用 phpMs。

API 文档

最新版本的 API 可在以下位置找到:http://pgb.liv.ac.uk/ci/phpMs/doc/

用法示例

有关如何使用 API 的示例,请参阅 phpMs 示例套件。通过 http://pgb.liv.ac.uk/phpMs 也可以查看实时演示。